Действия сериала происходят в альтернативной вселенной и разворачиваются вокруг нескольких девочек. Их зовут Фубуки, Юдачи и Муцуки, и они являются духами военных кораблей и субмарин времён Второй мировой войны. Однажды на землю из глубин морей и океанов вторгаются неизвестные враги, прозвавшие себя «Флотом глубокого моря».
